Biochimie Structurale: Cours, TD, & Examens Corrigé -S3 PDF

Biochimie Structurale

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Plan du Cours

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Chapitre I : Structure et propriétés des glucides

  1. Les oses : Plan de base des oses, appellation des oses, diversité, filiation, conformation spatiale, propriétés physico-chimique, intérêt biologique.
  2. Les oligosides : Liaison 0-glycosidique, diversité d’enchainement, convention d’écriture, analyse structurale des oligosaccharides
  3. Les polysaccharides : perméthylation des homopolysaccharides et hétéropolysaccharides, détermination de leur structure
  4. Les hétérosides

Chapitre II : Structure et propriétés des lipides

  1. Les acides gras : structure chimique, nomenclature, nombre d’atome de C, nombre de doubles liaisons, numéros d’atomes de C qui portent les doubles liaisons, propriétés physico-chimiques, configuration des doubles liaisons, acides gras saturés, acides gras non saturés
  2. Les acylglycérols : formules développées et nomenclature, propriétés, hydrolyse
  3. Principaux constituants des membranes biologiques : phosphoglycérides, sphingolipides, stérols, stéroïdes et dérivés de Terpènes

Chapitre III : Structure et propriétés des amino-acides et des protéines

  1. Les acides aminés : structure, nomenclature, propriétés physico-chimique, méthode de détection, dosage
  2. Les Peptides : liaison peptidique, méthode d’analyse de la séquence peptidique, étude de quelques peptides importants
  3. Les protéines : propriétés physico-chimiques, structure tridimensionnelles, conformationnelle et ordonnée, fractionnement (purification et extraction).

Chapitre IV : Structure et propriétés des acides nucléiques

  1. Constituants des acides nucléiques : ADN, ARN, Bases azotées et leurs propriétés, les nucléosides, les nucléotides
  2. Structure des acides nucléique : structure primaire et polymérisation, structure secondaire de l’ADN et ARN, structure tertiaire de l’ADN
  3. Caractéristiques physico-chimiques et fonctionnelles de l’ADN : propriétés physicochimiques, méthodes d’étude, conservation de l’information génétique
  4. Types et caractéristiques des ARN : différents types d’ARN, fonction et rôle, transcription et traduction, notion de code génétique

Travaux dirigés
TD1- Structure et propriétés des oses et de leurs dérivés
TD2- Structure et propriétés des lipides
TD3- Acides aminés et protéines : structures, conformations & propriétés
TD4- Acides nucléiques : structures et propriétés

Travaux pratiques
(Les manipulations sont données à titre d’exemple)
TP1- Séparation des acides aminés d’un mélange par chromatographie de partage
TP2- détermination de l’indice de saponification d’un lipide (Huile de ricin par exemple)
TP3 Extraction de l’ADN d’oignon
TP4- Propriétés physique des acides nucléiques : spectre d’absorption
TP5- Détermination du pHi d’acide aminé (Glycine par exemple)


Introduction

Objectif :
Faire acquérir aux étudiants les structures chimiques des différents composants d’organismes vivants, notamment les glucides, les lipides, les acides aminés, les protéines et les acides nucléiques.
Initier aux étudiants les propriétés particulières du milieu aqueux.

La biochimie est l’étude des réactions chimiques qui se déroulent au sein des êtres vivants, et notamment dans les cellules. La complexité des processus chimiques biologiques est contrôlée à travers la signalisation cellulaire et les transferts d’énergie au cours du métabolisme.

Depuis un demi-siècle, la biochimie est parvenue à rendre compte d’un nombre considérable de processus biologiques, au point que pratiquement tous les domaines de la biologie, depuis la botanique jusqu’à la médecine, sont aujourd’hui engagés dans la recherche biochimique, voire biotechnologique.

L’objectif principal de la biochimie de nos jours est de comprendre, en intégrant les données obtenues au niveau moléculaire, comment les biomolécules et leurs interactions génèrent les structures et les processus biologiques observés dans les cellules, ouvrant la voie à la compréhension des organismes dans leur ensemble.

²Dans ce cadre, la chimie supramoléculaire s’intéresse aux complexes moléculaires tels que les organites, qui constituent un niveau d’organisation de la matière vivante intermédiaire entre les molécules et les cellules.


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